Podstawową rośliną wykorzystywaną w oczyszczalniach gruntowo korzeniowych jest trzcina pospolita. Oprócz niej sadzi się mannę mielec, pałkę wodną lub sitowie.

Rośliny odżywiają się składnikami znajdującymi się w ściekach, dzięki czemu ulegają one rozkładowi. Proces oczyszczania obejmuje także redukcję związków biogennych – związków fosforu i azotu, które stanowią zagrożenie dla wód powierzchniowych.